data("IBD_simulation_data")
start_params <- rep(0.3, 3)
names(start_params) <- 1:3
start_params <- c(start_params, "m"= 250)
#run
ret <- discent::deme_inbreeding_spcoef_vanilla(discdat = IBD_simulation_data,
start_params = start_params,
learningrate = 1e-3,
lambda = 0.01,
m_lowerbound = 0,
m_upperbound = Inf,
b1 = 0.9,
b2 = 0.999,
e = 1e-8,
steps = 1e4,
thin = 1,
normalize_geodist = TRUE,
report_progress = TRUE,
return_verbose = TRUE)
#> DISC step 100
#> DISC step 200
#> DISC step 300
#> DISC step 400
#> DISC step 500
#> DISC step 600
#> DISC step 700
#> DISC step 800
#> DISC step 900
#> DISC step 1000
#> DISC step 1100
#> DISC step 1200
#> DISC step 1300
#> DISC step 1400
#> DISC step 1500
#> DISC step 1600
#> DISC step 1700
#> DISC step 1800
#> DISC step 1900
#> DISC step 2000
#> DISC step 2100
#> DISC step 2200
#> DISC step 2300
#> DISC step 2400
#> DISC step 2500
#> DISC step 2600
#> DISC step 2700
#> DISC step 2800
#> DISC step 2900
#> DISC step 3000
#> DISC step 3100
#> DISC step 3200
#> DISC step 3300
#> DISC step 3400
#> DISC step 3500
#> DISC step 3600
#> DISC step 3700
#> DISC step 3800
#> DISC step 3900
#> DISC step 4000
#> DISC step 4100
#> DISC step 4200
#> DISC step 4300
#> DISC step 4400
#> DISC step 4500
#> DISC step 4600
#> DISC step 4700
#> DISC step 4800
#> DISC step 4900
#> DISC step 5000
#> DISC step 5100
#> DISC step 5200
#> DISC step 5300
#> DISC step 5400
#> DISC step 5500
#> DISC step 5600
#> DISC step 5700
#> DISC step 5800
#> DISC step 5900
#> DISC step 6000
#> DISC step 6100
#> DISC step 6200
#> DISC step 6300
#> DISC step 6400
#> DISC step 6500
#> DISC step 6600
#> DISC step 6700
#> DISC step 6800
#> DISC step 6900
#> DISC step 7000
#> DISC step 7100
#> DISC step 7200
#> DISC step 7300
#> DISC step 7400
#> DISC step 7500
#> DISC step 7600
#> DISC step 7700
#> DISC step 7800
#> DISC step 7900
#> DISC step 8000
#> DISC step 8100
#> DISC step 8200
#> DISC step 8300
#> DISC step 8400
#> DISC step 8500
#> DISC step 8600
#> DISC step 8700
#> DISC step 8800
#> DISC step 8900
#> DISC step 9000
#> DISC step 9100
#> DISC step 9200
#> DISC step 9300
#> DISC step 9400
#> DISC step 9500
#> DISC step 9600
#> DISC step 9700
#> DISC step 9800
#> DISC step 9900
#> DISC step 10000